Meelis Niinepuu on juhtimiskonsultatsiooniettevõtte Civitta asutaja. 2001. aastal asutatud ettevõtte tegutseb tänaseks 12 riigis ja sellel on pea 300 töötajat. Civittas on Meelis vastutanud suurte taristuprojektide ettevalmistamise ja elluviimise eest nii kohalikul kui rahvusvahelisel tasandil. Ta on investeerimisettevõtte Wiser üks kaasasutajatest.

Lisaks tegevusele ettevõtluses on Meelis aktiivne ka ühiskondlikult. Ta on Eesti Mälu Instituudi nõukogu esimees ja Rail Baltic Business Network’i juhatuse liige.

Meelis on õppinud Tartu Ülikoolis avalikku haldust ning osalenud ettevõtluse ja tehnoloogia juhtimise magistriprogrammis. Tal on pikaajaline Euroopa liidu välisabi projektide nõustamise ja juhtimise kogemus.